El género conocido como sandbox, inaugurado por Grand Theft Auto, se prepara para sufrir una nueva revolución. Un hombre sin memoria, modificado genéticamente, disfrutará de la libertad característica de estos juegos combinada con un poder de destrucción casi ilimitado. Prototype se perfila como uno de los títulos más prometedores de cara al verano.
En este título, los jugadores se pondrán a los mandos de Alex Mercer, un hombre mutante con un dominio absoluto de su estructura genética, que recorre las calles de Nueva York en busca de su pasado.
Tendrán que sumergirse en una red de mentiras, en una trama de conspiraciones y virus mortales, en la que habrá que arrancar la verdad de aquellos que se la han ocultado al público durante cuarenta años.